Призрак в доспехах: Синдром одиночки 2

Дело «Смеющийся человек» официально закрыто. В результате этого, новоизбранный премьер-министр Японии Юко Каябуки возобновил работу организации  "Девятый отдел". Но появилась новая проблема, которая стала основной причиной для возвращения отдела. Группа, что носит имя «Одиннадцать человек», начала исполнять террористические акты по территории всей Страны восходящего солнца.

Пока Мотоко Кусанаги, Дайсуке Арамаки, Бато и иные члены "Девятого отдела" расследуют опасность, японское правительство встречается с ещё одной бедой. Третья Мировая война заставила множество беженцев бежать в поиске безопасного укрытия. Толпы рванули в Японию, где ситуация стабильна. Члены организации на каждом задании встречаются с Гауда Казундо и начинают подозревать его в преступлениях.