Наруто 2: Большое столкновение! Призрачные руины в глубине земли

События данной истории разворачиваются в средневековой Японии. Молодой парень Наруто, как и все другие шиноби, занимается тем, что выполняет различные миссии жителей деревни, и старается набирать силу и смелость. Однажды основной персонаж вместе с Сакурой и Шикамару отправляется на очередное задание.

Им предстоит отыскать пропавшее домашнее животное, из-за чего попадают в достаточно опасную ситуацию, когда на них было совершено нападение со стороны неизвестных персонажей. Так получилось, что Наруто отстал от друзей, и теперь ему предстоит найти дорогу, ведущую к ним. Внезапно Наруто натыкается на загадочную цивилизацию, и понимает, что в мире есть не только чакра, а также другая невероятная сила, способная изменить все вокруг.